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青霉素、紫杉醇…藏在藥物分子背后的藝術

2019/11/16
導讀
你一定見過藥品說明書中的分子結構示意圖。在吞下藥片的一瞬間,或許你不會想到這些分子背后究竟隱藏著什么故事、化學家是如何合成它們的…

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你一定見過藥品說明書中的分子結構示意圖。在吞下藥片的一瞬間,或許你不會想到這些分子背后究竟隱藏著什么故事、化學家是如何合成它們的…





動物、植物、昆蟲、海洋生物和微生物體內(nèi)的組成成分或其代謝產(chǎn)物以及人與動物體內(nèi)許許多多內(nèi)源性的化學成分統(tǒng)稱天然產(chǎn)物。其中有相當一部分具有生物活性,也因此受到人們的廣泛關注,一些甚至已經(jīng)成為必不可少的藥物。合成這些分子也因此成為有機化學的一大驅動力。

天然產(chǎn)物的化學成分往往十分復雜,許多天然產(chǎn)物的合成都頗具挑戰(zhàn)性,尤其是含有本次演講涉及的多取代芳環(huán)的芳香天然產(chǎn)物的合成。天然產(chǎn)物合成研究上的突破,既能促進有機化學學科以及諸多交叉學科的發(fā)展,又對醫(yī)療、制藥等產(chǎn)業(yè)的發(fā)展有著重要的指導意義。

據(jù)統(tǒng)計,2000年,世界排名銷售前35的處方藥中,約40%的藥物為化學合成衍生的,另外40%的藥物是天然產(chǎn)物衍生的。毋庸質疑,合成化學在其中起到了巨大的作用。通過下面的三段故事,或許讀者能感受到化學全合成的重要性。



助力新藥研發(fā)

1986年,日本科學家從收集來的600kg海綿Halichondria okadai中分離出12.5mg天然產(chǎn)物Halichondrin B。這一長相奇特、結構復雜的化合物被證明對腫瘤細胞有極強的抑制作用,罹患癌癥的老鼠使用藥物后壽命明顯增加。然而其極低的產(chǎn)量無論是對科研還是商業(yè)化都是極大的約束。這一化合物倘若商業(yè)化藥用,每年大約需要數(shù)公斤。然而棲息地中海綿的總重量不過數(shù)百噸,即便全部開采藥用也只能提取出幾十克純的Halichondrin B。要獲得如此大量化合物的辦法只能通過化學合成。

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6年之后,合成化學家Kishi首次以長達47步完成了這一化合物的全合成。以此為基礎,在原化合物的結構上不斷修改,在降低結構復雜度的同時盡量保持活性,最終成為用于治療乳腺癌的藥物艾日布林(Eribulin,商品名Halaven)。如今,Halaven能夠以一次數(shù)百克的產(chǎn)量合成。值得注意的是,這一當今世界最長的藥物合成路線正是由當年Kishi的合成路線修改而來的。Halaven的研究歷程也因此成為合成化學史上的一段佳話,更體現(xiàn)了全合成在藥物研發(fā)中強大的能力。


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HalichondrinB的結構式


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艾日布林(Eribulin)的結構式

左側保持了HalichondrinB的結構,但右側已經(jīng)大大簡化。



拓展藥物來源

紫杉醇是一種家喻戶曉的抗癌藥物。1978年,由于發(fā)現(xiàn)了其獨特的抗癌機理,人們開始大量研究這一化合物。但是由于缺乏合成手段,人們只能從一種生長緩慢的短葉雪松的樹皮中提取紫杉醇。但是由于需求量十分巨大,加上從樹中能提取出來的紫杉醇又特別的少,該短葉雪松于1990年由于過度砍伐被列為了瀕危物種。來源的短缺使得對紫杉醇的研究停滯不前。這一局面最后是由合成化學家們打破的。1992年Holton注冊了半合成紫杉醇的專利,使得人們不用通過采集樹皮的方式來獲得紫杉醇。隨后經(jīng)過合成化學家們的努力,又出現(xiàn)了大量的紫杉醇全合成路線,幫助人類獲取更多紫杉醇,大大推動了紫杉醇的研究與臨床應用,拯救了大量生命。


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從紅豆杉的樹皮中獲取紫杉醇


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從含量相對豐富的10-去乙?;涂ㄍII合成珍貴的紫杉醇分子


揭秘生物合成

對于生命過程的探索一直是最吸引人,也是最神秘的領域之一。模仿生命中進行的化學反應不僅能讓我們更加接近這一神奇的過程,更有可能讓化學合成事半功倍,便有了仿生合成。對于天然產(chǎn)物的全合成而言,仿生合成的策略也在復雜天然產(chǎn)物的合成研究中顯現(xiàn)出了強大的威力。仿生合成并不是對于生物合成的生搬硬套,由于酶催化和化學合成反應之間的差異,這更需要對于反應充分的理解,需要非常高的有機合成功底。李昂老師在這一方面有非常多出色的工作,例如對于hapalindole-type天然產(chǎn)物的全合成,其斷鍵新穎性和高效性都非常令人佩服,仿生合成的策略的藝術體現(xiàn)得淋漓盡致。

 

 

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hapalindole-type天然產(chǎn)物可能的生物合成途徑

 

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采用仿生合成的策略的全合成路線

來源:Z. Lu, M. Yang, P. Chen, X. Xiong, A. Li, Angew. Chem. Int. Ed. 2014, 53, 13840–13844.

 

復雜天然產(chǎn)物如同藝術品一般的空間結構一直吸引著諸多合成化學家,其潛在的生物活性更有可能成為治療疾病的鑰匙,為人類的健康造福。復雜空間結構的構建并不容易,需要不懈的探索和努力,過程中不免會遇到困難和瓶頸,甚至可能會徒勞無功,但一直以來無數(shù)合成化學家的熱情不斷推動著天然產(chǎn)物合成的發(fā)展?;蛟S建筑設計師更善于構建精美的空間架構,但與建筑設計師不同的是,合成化學家們已經(jīng)知曉了目標的(大致)結構,重心放在了如何用更加“藝術”、高效方式構建起空間中的原子排列。例如芳環(huán)的結構在天然產(chǎn)物普遍存在,構建這類化合物的結構很經(jīng)典的兩類反應就是Friedel-Crafts反應和交叉偶聯(lián)反應——想必大多數(shù)人在甚至高中課本上都或多或少接觸過,然而它們在合成上并不是全能的。上海有機化學研究所的李昂研究員發(fā)展了通過6π電環(huán)化合成芳環(huán)的方法,并完成了一系列復雜結構天然產(chǎn)物的全合成,拓展了芳環(huán)合成的策略。本次演講中,他就將與我們探討利用6電環(huán)化/芳構化反應合成結構復雜的芳香天然產(chǎn)物的策略。


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6π電環(huán)化反應構建芳環(huán)一例:Rubriflordilactone?B的合成

來源:P. Yang, M. Yao, J. Li, Y. Li, A. Li, Angew. Chem. Int. Ed. 2016, 55, 6964.



注:本文轉載自公眾號未來論壇。


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