為何追求科學(xué)的透明與開放
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在今年早些時(shí)候，我們宣布對于Communications Biology的所有投稿，將實(shí)行透明同行評審制度。這一制度與Nature Communications所實(shí)施的相同：即作者需要在稿件被接收時(shí)選擇同意或拒絕發(fā)表審稿報(bào)告和作者答復(fù)。審稿人也會(huì)被告知，一旦他們接受了審稿邀請，就意味著同意以匿名的方式發(fā)表他們的審稿意見（如果愿意的話也可以不匿名）。盡管目前要做數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)還為時(shí)過早，但是迄今為止生命科學(xué)領(lǐng)域?qū)?em style="margin: 0px; padding: 0px; max-width: 100%; box-sizing: border-box; word-wrap: break-word !important;">Nature Communications這一新制度的積極反響，使我們備受鼓舞。
我們在5月8日發(fā)表了第一篇附有全部審稿報(bào)告和作者答復(fù)的文章，這些文件與其他補(bǔ)充信息放在了一起（圖1）。此外，與最近發(fā)表在Genome Biology和Nature Communications上的研究結(jié)果一致，我們發(fā)現(xiàn)這一新的舉措不會(huì)影響審稿邀請的接受率以及審稿質(zhì)量或速度。
圖1：審稿報(bào)告可在補(bǔ)充信息中下載
那么，我們?yōu)楹我扇∵@項(xiàng)舉措呢？
我們強(qiáng)烈認(rèn)為，期刊的同行評審和出版過程應(yīng)盡可能透明。其中一種做法就是在發(fā)表文章時(shí)提供審稿報(bào)告作為補(bǔ)充信息。任何有經(jīng)驗(yàn)的編輯想必都有體會(huì)，審稿的過程容易混亂，審稿人的意見可能不相同，作者可能無法滿足每位審稿人的每一個(gè)要求。但最終，這個(gè)過程能提升論文質(zhì)量，使我們有足夠的自信去發(fā)表這些研究。通過選擇透明同行評審，作者們幫助照亮了傳播嚴(yán)謹(jǐn)科學(xué)的道路。
我們的其他相關(guān)政策也在倡議作者幫助提高論文的透明度，例如要求作者發(fā)表“自然研究報(bào)告摘要 （Nature Research Reporting Summary）”，報(bào)告中包含許多重要信息，例如研究設(shè)計(jì)，統(tǒng)計(jì)分析和數(shù)據(jù)的可訪問性等等。同時(shí)還要求作者在論文的“方法”章節(jié)中盡可能提供詳細(xì)的信息，并且不限制該章節(jié)的字?jǐn)?shù)。
但我們知道，為了進(jìn)一步提升科研界的開放與透明，需要改進(jìn)的地方還有許多，例如我們的“數(shù)據(jù)可獲得性聲明”。與所有自然科研旗下期刊一樣，原創(chuàng)性研究的作者需要在論文中說明數(shù)據(jù)是否可以獲得，以及在哪可以獲得。并且對于某些數(shù)據(jù)類型，我們會(huì)要求其必須是可獲得的。但是，目前許多聲明仍只是簡單地表明，數(shù)據(jù)可以在申請后提供（data are available upon request）。
我們應(yīng)該可以做得更好。目前，我們會(huì)要求作者盡可能詳細(xì)的表明論文數(shù)據(jù)的獲取方法。不過我們同時(shí)也明白，并非所有的數(shù)據(jù)類型都適合被公開。但至少，作者需要說明為什么該數(shù)據(jù)的訪問性會(huì)受到限制，或者不適合存儲(chǔ)在公開的數(shù)據(jù)庫。
此外，我們會(huì)要求重要圖表中的數(shù)據(jù)可以在補(bǔ)充材料中或通過在線數(shù)據(jù)庫獲得。自今年年初我們開始嘗試這一舉措后，至今已有超過85%的作者在提交發(fā)表論文時(shí)一并提交了原始數(shù)據(jù)。雖然提供的原始數(shù)據(jù)僅包括用于繪制圖形的處理數(shù)據(jù)，但我們認(rèn)為納入這些數(shù)據(jù)對于研究的可重復(fù)性和透明度都很重要。讀者能夠比以往更方便而直觀地去閱讀和理解研究結(jié)果。也正是出于這一原因，我們和其他自然科研旗下期刊一樣，會(huì)要求作者在條形圖上繪制單個(gè)點(diǎn)，如果樣本量充足的話，則將這些圖轉(zhuǎn)換為箱形圖（圖2）。
圖2：幾張顯示了數(shù)據(jù)分布的圖例
我們的種種舉措，大力提倡提高同行評審、編輯流程、方法報(bào)告和數(shù)據(jù)可用性的透明度，都是為了幫助實(shí)現(xiàn)同一個(gè)目標(biāo)：確保發(fā)表研究的嚴(yán)謹(jǐn)性及可重復(fù)性，以加強(qiáng)科研的信任度。
注：本文轉(zhuǎn)載自Nature自然科研。
