哪些基因突變會誘發(fā)乳腺癌?這個科學(xué)家分析了4000個基因突變
編譯 | 周 楊
責(zé)編 | 葉水送
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本周,《自然》雜志發(fā)表了一項(xiàng)關(guān)于乳腺癌的重磅研究,這項(xiàng)研究對近4000個BRCA1基因突變類型進(jìn)行了分析。該研究的分析結(jié)果將有望使乳腺癌或卵巢癌的基因檢測更加準(zhǔn)確有效。
BRCA1基因可抑制腫瘤,但其確切的機(jī)制尚不完全清楚。已知該基因中的某些突變使女性有患乳腺癌和卵巢癌風(fēng)險(xiǎn)。
如果身體健康的女性盡早接受基因檢測并及時(shí)發(fā)現(xiàn)這種突變,手術(shù)或更頻繁的篩查可大大降低她們患這類癌癥的風(fēng)險(xiǎn)。然而,許多女性發(fā)現(xiàn)她們的BRCA1基因含有一種不確定的變異。
盡管目前來講,這些突變還沒有被發(fā)現(xiàn)會誘發(fā)癌癥,而該基因的突變達(dá)數(shù)千種,因此人們并不清楚哪些突變可能會誘發(fā)癌癥。
華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院教授、該研究的牽頭人Greg Findlay博士對此表達(dá)了他的擔(dān)憂,很多女性很有可能體內(nèi)存在導(dǎo)致癌癥的基因變種,但由于基因檢測無法識別,因此她們無法對此有效預(yù)防,或在早期進(jìn)行治療。
這項(xiàng)研究的另一位作者Jay Shendure也解釋到,“即使基因組測序的成本急劇下降,我們也無法從測試結(jié)果中得到有效信息?!?/p>
研究者利用基因編輯對基因的修飾模擬人類的基因突變,圖片來自nature
為了更好地幫助臨床醫(yī)生和患者獲得有關(guān)遺傳變異信息,F(xiàn)indlay開發(fā)了一種名為“飽和基因組編輯”( saturation genome editing)的研究方法。研究人員對BRCA1基因進(jìn)行了數(shù)千次微小的修改,有些甚至是人類尚未見過的突變。然后他們再逐一測量每個突變的影響,看看哪些突變會使培養(yǎng)皿中的人類細(xì)胞出現(xiàn)問題。
研究人員發(fā)現(xiàn),在實(shí)驗(yàn)室中研究BRCA1基因的變化,以令人驚訝的準(zhǔn)確性反映了該變體患者的情況,即培養(yǎng)皿中更改基因而出現(xiàn)問題的細(xì)胞,和在患者身上觀察到的一致。
“我們基本上將BRCA1基因關(guān)鍵區(qū)域所有可能的變種都進(jìn)行了模擬,不管是否可能導(dǎo)致癌癥?!盕indlay說。
研究人員用大約6個月測試近4000個突變。他們還計(jì)劃未來幾年涵蓋所有BRCA1基因的變種。
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Findlay GM. Accurate classification of BRCA1 variants with saturation genome editing. Nature. 2018. DOI:10.1038/s41586-018-0461-z.