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老兵不死:百年億蠅為哪般?

2019/02/20
導(dǎo)讀
研究果蠅有什么意義?

32

Old soldiers never die, they just fade away.

——Douglas MacArthur


撰文 | 饒毅


研究果蠅有什么意義?幾毫米長(zhǎng)的昆蟲(chóng),為何一百多年活躍在生物科學(xué)研究的中心?一文不值的蠅子為何今天還是數(shù)以千計(jì)博士教授養(yǎng)家糊口的道具?腦中有百億神經(jīng)細(xì)胞的人為何還不理解僅幾十萬(wàn)神經(jīng)細(xì)胞的果蠅?


在1933年、1947年、1995年、2011年和2017年,五次諾貝爾獎(jiǎng)分別授予九位研究果蠅的科學(xué)家。時(shí)至今日,跨越百年的果蠅研究仍然興旺。


麥克阿瑟將軍所謂“老兵不死”,對(duì)果蠅研究似亦適用。


并非罕見(jiàn):國(guó)內(nèi)輕視科學(xué) 國(guó)外誤判果蠅

中國(guó)文化長(zhǎng)期存在輕視理論的傾向,發(fā)展到文化大革命期間表現(xiàn)突出,導(dǎo)演出令人記憶深刻的電影鏡頭:農(nóng)學(xué)院(彼時(shí)所謂“共產(chǎn)主義勞動(dòng)大學(xué)”)的教授在上課的時(shí)候,講“馬尾巴的功能”。這種故意將教育和科學(xué)推到極端以便嘲笑的做法,今天雖不很多,但并未絕跡。與其相似的否定自然科學(xué)的思維,在中國(guó)和中文世界有各種翻版不斷出現(xiàn)。典型的是做應(yīng)用和做技術(shù)的輕視做科學(xué)和做基礎(chǔ)的,不過(guò)輕飄飄否定基礎(chǔ)科學(xué)邏輯的延伸,等同文革期間的說(shuō)法:知識(shí)分子無(wú)用,既不能做工,又不能務(wù)農(nóng)。也就是說(shuō)所有不是工人、農(nóng)民的人都是寄生蟲(chóng),要按原始社會(huì)設(shè)計(jì)現(xiàn)代社會(huì)、否定歷史自然發(fā)展的科學(xué)和文化等方面的職業(yè)。當(dāng)時(shí)譏笑弱勢(shì)的教授貌似俏皮的劇作家,映照了反智的文化,實(shí)踐證明歷史的笑料是導(dǎo)致劇作的政治負(fù)責(zé)人,而不是教授。


哈佛大學(xué)教授不刻意歪曲科學(xué),但也曾誤判果蠅研究的重要性。比如, William Wheeler于1923年輕蔑地稱(chēng)遺傳學(xué)為生物學(xué)參天大樹(shù)上一個(gè)自我陶醉的、根基有限的“親愛(ài)的小枝芽”,而哈佛大學(xué)古植物學(xué)家Jeffrey到1925年還看不上果蠅研究。我們現(xiàn)在知道,被歷史所棄的是他們的判斷和言論。


也常有人以為可以告別果蠅,卻有其他科學(xué)家認(rèn)為果蠅仍大有可為,果蠅研究不斷給人類(lèi)以啟示。


五次諾獎(jiǎng):果蠅研究的歷程

果蠅(fruit flies)是英文俗稱(chēng),拉丁名Drosophila原意“愛(ài)露”。果蠅取材方便,香蕉、蘋(píng)果放在窗戶便能收集果蠅。亞里士多德時(shí)代就記載了果蠅。1910年,美國(guó)遺傳學(xué)家摩爾根(Thomas H Morgan)以果蠅作為研究工具發(fā)表論文,他和學(xué)生奠定了果蠅的百年輝煌。


1933年諾貝爾獎(jiǎng)授予摩爾根,因?yàn)樗约号c學(xué)生從1910年到1915年(為主),用果蠅的研究完善和豐富了基因的染色體學(xué)說(shuō);


1947年諾貝爾獎(jiǎng)授予摩爾根的學(xué)生Hermann Joseph Muller,他在1927年用果蠅發(fā)現(xiàn)X線可以誘導(dǎo)遺傳突變,確定遺傳突變有物理基礎(chǔ)


1995年諾貝爾獎(jiǎng)授予摩爾根學(xué)生Sturtevant的學(xué)生Ed Lewis,德國(guó)的Christiane Nüsslein-Volhard和美國(guó)的Eric Wieschaus。他們用果蠅研究發(fā)育,Lewis的工作主要集中在20世紀(jì)50年代到70年代,Nüsslein-Volhard和Wieschaus的則是20世紀(jì)70年代末期到80年代。Nüsslein-Volhard和Wieschaus的工作掀起了全世界研究果蠅的第二次高潮;


2011年的諾貝爾獎(jiǎng)授予在法國(guó)工作的Jules Hoffman,他用果蠅研究先天免疫。他的主要工作出現(xiàn)于1995年,當(dāng)時(shí)已經(jīng)是第二次果蠅研究高潮的尾端,很多人認(rèn)為果蠅又要過(guò)時(shí)了。Hoffman和他的同事在果蠅中發(fā)現(xiàn)了對(duì)抵抗細(xì)菌感染十分重要的基因Toll,而此前Nüsslein-Volhard和其他實(shí)驗(yàn)室的研究發(fā)現(xiàn),Toll編碼的蛋白質(zhì)及其相關(guān)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路參與果蠅腹背軸的形成。Hoffman等人發(fā)現(xiàn),此信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路從Toll受體開(kāi)始不僅參與腹背軸形成,也參與抗感染,而在配體Spatzle以上只參與腹背軸形成,不參與抗感染。不久,多個(gè)實(shí)驗(yàn)室——耶魯大學(xué)的Charles Janeway和德州大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心的Bruce Beutler等——證明Toll類(lèi)似的蛋白質(zhì)在哺乳類(lèi)中也參與先天免疫。


2017年的諾貝爾獎(jiǎng)授予Rockefeller大學(xué)的Michael Young,Brandeis大學(xué)的Jeffrey Hall和Michael Rosbash,他們研究生物鐘的分子機(jī)理。在該領(lǐng)域,還有一位代表性科學(xué)家為已故的加州理工學(xué)院教授Seymour Benzer。他們的工作揭示了參與生物鐘的基因。其后Joseph Takahashi等人發(fā)現(xiàn)了小鼠生物鐘的分子,證明從果蠅到人都有極為相似的機(jī)理。


研究果蠅直接對(duì)遺傳學(xué)、演化、發(fā)育生物學(xué)起了關(guān)鍵作用,對(duì)神經(jīng)生物學(xué)起了重要作用,對(duì)細(xì)胞生物學(xué)和免疫學(xué)起了作用。果蠅研究還通過(guò)遺傳學(xué)推動(dòng)了多個(gè)基礎(chǔ)和應(yīng)用學(xué)科的發(fā)展,間接影響很廣。



果蠅還沒(méi)老死?

一百多年后,果蠅仍然是很多人使用的研究工具,而且不斷出現(xiàn)重要發(fā)現(xiàn)。很多機(jī)構(gòu)仍然重視果蠅研究,例如,美國(guó)最大的慈善機(jī)構(gòu)休斯醫(yī)學(xué)研究所(HHMI),近年以重金新建研究部門(mén)(Janelia farm),其第一任領(lǐng)導(dǎo)是發(fā)明果蠅轉(zhuǎn)基因技術(shù)的Gerald Rubin。Janelia農(nóng)場(chǎng)的主要目標(biāo)是神經(jīng)環(huán)路和現(xiàn)代成像,而這兩個(gè)方向目前都有相當(dāng)大的力度是以果蠅的神經(jīng)系統(tǒng)為對(duì)象。


果蠅研究為何經(jīng)久不衰?


從研究方面來(lái)說(shuō),最早用果蠅是因?yàn)轲B(yǎng)起來(lái)容易(給點(diǎn)香蕉、蘋(píng)果泥都可以),繁殖快。從遺傳學(xué)來(lái)說(shuō),果蠅染色體數(shù)量少,只有4對(duì),其中第四號(hào)染色體很小。到1933年以后,果蠅多線型染色體的發(fā)現(xiàn),便于研究基因與染色體的關(guān)系,容易對(duì)有些基因進(jìn)行物理定位(如果突變影響了可見(jiàn)的染色條帶)?;驐l帶從此用了幾十年,一直到果蠅基因組測(cè)序后才很少人用。


一種生物為很多研究者所用,不同研究者制造不同工具與大家共享,導(dǎo)致該生物體成為模式生物。果蠅就是一種重要的模式生物。


  • 斯坦福大學(xué)的David Hogness在20世紀(jì)70年代與大家共享克隆果蠅基因的方法。

  • 1982年,當(dāng)時(shí)在Carnegie Institute of Washington的Rubin與Allan Spradling發(fā)明P轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的果蠅轉(zhuǎn)基因方法,由此衍生了多個(gè)方法,如1987年瑞士的O’Kane與Gehring發(fā)明果蠅的enhancer trap,1988年美國(guó)的Lynn Cooley與Spradling用P轉(zhuǎn)座子進(jìn)行插入性遺傳突變等等。

  • 德國(guó)的Tautz與Pfeifle于1989年發(fā)明用非同位素方法進(jìn)行原位雜交,改觀了基因表達(dá)的檢測(cè)。

  • 1989年,美國(guó)芝加哥大學(xué)的Golic與Linquist將酵母Flp/FRT系統(tǒng)引入果蠅,有利于果蠅遺傳分析。1993年加州大學(xué)伯克利分校的許田與Rubin將其衍生后用于嵌合體分析。

  • 1993年哈佛醫(yī)學(xué)院的Brand與Perrimon將細(xì)菌Gal4-UAS引入果蠅,歷經(jīng)二十年很多人通過(guò)利用它進(jìn)行基因表達(dá)的時(shí)間和空間控制。

  • 1999年斯坦福大學(xué)的駱利群與李次明很巧妙地建立MARCM方法,可以分析單個(gè)細(xì)胞基因差別帶來(lái)的表型(Lee and Luo, 1999)。

  • 2000年,落后于老鼠十幾年后,Golic和他的中國(guó)研究生榮當(dāng)時(shí)在猶他大學(xué)終于發(fā)明了果蠅的基因剔除技術(shù)(Rong and Golic, 2000)。

  • 德國(guó)的Nagel等(2003)和美國(guó)的Boyden等(2005)發(fā)明光遺傳學(xué)技術(shù),現(xiàn)在可以用光刺激和抑制神經(jīng)元活動(dòng),其應(yīng)用在果蠅中最多、最快。

  • 可逆性抑制神經(jīng)遞質(zhì)釋放的技術(shù)(Kitamoto,2001),迄今只能在果蠅做。

  • 今天,果蠅還被作為研究癌癥和其他疾病的模型(Brumby and Richardson,2005;Bilen and Bonini,2005; Harvey et al.,2013;Gonzalez,2013),并可用以篩選治療方法和藥物(Gonzalez,2013)


果蠅的研究對(duì)高等動(dòng)物有什么意義?這取決于研究的問(wèn)題。基本的遺傳學(xué)規(guī)律從果蠅到人很相似,而參與具體生物學(xué)過(guò)程的基因,就不是很容易事先預(yù)計(jì)是否相似。有些看起來(lái)好像應(yīng)該會(huì)相關(guān)的,后來(lái)發(fā)現(xiàn)無(wú)關(guān)。比如果蠅的性決定(形成雄性還是雌性果蠅)取決于XY和XX染色體,表面上好像和人相似,其實(shí)不同。20世紀(jì)80年代和90年代發(fā)現(xiàn)果蠅和人的性決定基因后,研究者發(fā)現(xiàn)它們用的基因絕大多數(shù)毫不相同。


有些生物學(xué)過(guò)程,果蠅和人好像很不一樣,卻有相似的分子機(jī)理。胚胎發(fā)育的基因就是很好的例子。果蠅胚胎是功能合胞體,在早期胚胎分裂時(shí),只有細(xì)胞核分裂,沒(méi)有細(xì)胞膜分裂,直到幾千個(gè)細(xì)胞核再開(kāi)始形成細(xì)胞膜,變成分開(kāi)的細(xì)胞。而哺乳類(lèi)胚胎,當(dāng)然是一個(gè)細(xì)胞分裂成為兩個(gè)細(xì)胞,幾千個(gè)都是分開(kāi)的細(xì)胞,而不是幾千個(gè)細(xì)胞核共用一個(gè)細(xì)胞。這樣巨大的差別使很多人認(rèn)為研究果蠅早期發(fā)育可能對(duì)人類(lèi)無(wú)意義,是科學(xué)家浪費(fèi)錢(qián)、鉆牛角尖。但是,研究了控制果蠅發(fā)育的基因后,研究者找到它們的哺乳類(lèi)(包括人類(lèi))的相應(yīng)基因,結(jié)果發(fā)現(xiàn)不僅在原理上果蠅和人相似,在有些具體基因上也相似。因此,研究果蠅的發(fā)育為研究高等動(dòng)物的發(fā)育帶來(lái)了根本的突破。

 

麥克阿瑟引言的后半句是“戰(zhàn)士只消隱”,果蠅何時(shí)fade,恐怕不是目前在世的人能見(jiàn)到。一個(gè)生物是否用到盡頭?下一個(gè)前沿是什么?這樣的問(wèn)題只有少數(shù)人能回答正確,而且需要冒險(xiǎn)。多數(shù)人要等到結(jié)果出來(lái)后,才恍然大悟趕緊跟風(fēng)放棄一個(gè)生物,或跟上使用一種生物,研究一些新的問(wèn)題。




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2013年5月初稿,2019年1月修改


文章頭圖及封面圖片來(lái)源:raolab

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遺傳和分子神經(jīng)生物學(xué)家、北京大學(xué)講席教授、北京大學(xué)理學(xué)部主任、《知識(shí)分子》主編
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