利用基因“時鐘”預測脊椎動物的壽命

根據CpG密度和壽命點位估算壽命. | 來源:Mayne et al.
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本周《科學報告》發(fā)表的一項研究A genomic predictor of lifespan invertebrates報告了一種采用基因標記來準確估算不同脊椎動物物種壽命的模型。這個“壽命時鐘”篩選了CpG位點的42個特定基因,以預測某脊椎動物物種成員可能擁有多長的壽命。(CpG位點是DNA上的短片段,其密度與壽命相關。)
一個物種的最大壽命難以定義,而且物種之間存在巨大差異。過去的研究認為最大壽命由基因控制,但是到目前為止,仍沒有發(fā)現造成這種差異的基因變種。
澳大利亞聯邦科學與工業(yè)研究組織,印度洋海洋研究中心,環(huán)境經濟未來科學平臺的Benjamin Mayne等人在構建模型時,采用了252種壽命已知的脊椎動物的參考基因組,鑒定出了42個可能可以預測壽命的基因。作者發(fā)現,這些基因中的CpG密度對脊椎動物(包括已滅絕物種)的壽命具有較高的預測性。
作者以非洲象的基因組及其平均壽命(65年)為參照,利用模型估算出真猛犸象和古棱齒象的壽命為60年。以現代及早期人類和黑猩猩的基因組為參照,估算得出丹尼索瓦人和尼安德特人的壽命約為38年。作者還表明,他們的模型能夠估算長壽物種的壽命,如平塔島象龜和弓頭鯨,由于這類物種的壽命通常超過人類,因此預測其壽命是一件具有挑戰(zhàn)性的事。
作者認為以上發(fā)現可能有助于深入研究現存物種及已滅絕物種的生態(tài)學和演化、受威脅物種的保護以及可持續(xù)捕撈。
注:本文轉載自公眾號“Nature自然科研”。