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利用基因“時鐘”預測脊椎動物的壽命

2019/12/30
導讀
本周《科學報告》發(fā)表的一項研究報告了一種采用基因標記來準確估算不同脊椎動物物種壽命的模型。這個“壽命時鐘”篩選了CpG位點的42個特定基因,以預測某脊椎動物物種成員可能擁有多長的壽命。(CpG位點是DNA上的短片段,其密度與壽命相關。)
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根據CpG密度和壽命點位估算壽命. | 來源:Mayne et al.


  



本周《科學報告》發(fā)表的一項研究A genomic predictor of lifespan invertebrates報告了一種采用基因標記來準確估算不同脊椎動物物種壽命的模型。這個“壽命時鐘”篩選了CpG位點的42個特定基因,以預測某脊椎動物物種成員可能擁有多長的壽命。(CpG位點是DNA上的短片段,其密度與壽命相關。



一個物種的最大壽命難以定義,而且物種之間存在巨大差異。過去的研究認為最大壽命由基因控制,但是到目前為止,仍沒有發(fā)現造成這種差異的基因變種。


澳大利亞聯邦科學與工業(yè)研究組織,印度洋海洋研究中心,環(huán)境經濟未來科學平臺的Benjamin Mayne等人在構建模型時,采用了252種壽命已知的脊椎動物的參考基因組,鑒定出了42個可能可以預測壽命的基因。作者發(fā)現,這些基因中的CpG密度對脊椎動物(包括已滅絕物種)的壽命具有較高的預測性。


作者以非洲象的基因組及其平均壽命(65年)為參照,利用模型估算出真猛犸象和古棱齒象的壽命為60年。以現代及早期人類和黑猩猩的基因組為參照,估算得出丹尼索瓦人和尼安德特人的壽命約為38年。作者還表明,他們的模型能夠估算長壽物種的壽命,如平塔島象龜和弓頭鯨,由于這類物種的壽命通常超過人類,因此預測其壽命是一件具有挑戰(zhàn)性的事。


作者認為以上發(fā)現可能有助于深入研究現存物種及已滅絕物種的生態(tài)學和演化、受威脅物種的保護以及可持續(xù)捕撈。


注:本文轉載自公眾號“Nature自然科研”。


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