基因組分析揭示中國(guó)南方存在狼的地方性群體
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狼(Canis lupus)是家犬的野生祖先,是廣泛分布的陸生哺乳動(dòng)物,占據(jù)了歐亞大陸、北美、乃至北非等地。前人的研究表明狼具有復(fù)雜的系統(tǒng)發(fā)育和群體歷史,不僅受地理和生態(tài)環(huán)境影響存在群體結(jié)構(gòu),而且和家犬、郊狼(Coyote)、乃至豺存在明顯的、長(zhǎng)期的基因交流和群體混合現(xiàn)象。在中國(guó),狼不僅生活在青藏高原、東北、新疆、內(nèi)蒙等地,而且在中國(guó)的南方也有分布(Lu Wang et al. 2016.Zoological Research)。
為了系統(tǒng)研究中國(guó)南方狼的系統(tǒng)發(fā)育地位和群體歷史,我們首先和中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所國(guó)家動(dòng)物博物館,中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所昆明動(dòng)物博物館聯(lián)系,取得了浙江、江西、貴州等中國(guó)南方的狼皮張樣本,以及來(lái)自黑龍江和吉林的皮張樣本。
? 中國(guó)南方狼的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和基因交流
隨后,中國(guó)昆明動(dòng)物所分子進(jìn)化與基因組多樣性課題組與中國(guó)科學(xué)院古脊椎所古DNA實(shí)驗(yàn)室合作,提取了皮張樣本的DNA并全基因組測(cè)序。群體遺傳學(xué)分析發(fā)現(xiàn)中國(guó)南方的狼是一個(gè)單獨(dú)的群體,和中國(guó)北方、青藏高原狼有差異且關(guān)系最近。其次,我們發(fā)現(xiàn)采自浙江的狼個(gè)體基因組中存在一種遺傳組分,可能來(lái)自于犬科的另一個(gè)物種,且分歧時(shí)間大于狼和亞洲豺犬(Cuonalpinus)。我們的結(jié)果亦揭示犬科物種間的基因交流在物種形成過(guò)程中扮演了重要的作用,也提示古DNA的研究方法對(duì)動(dòng)物博物館館藏樣本有顯著的研究意義。該研究成果2019年9月11日在線發(fā)表于Cell旗下子刊iScience上(https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(19)30345-1)。
中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所王國(guó)棟研究員,中國(guó)科學(xué)院古脊椎所張明博士為文章的共同第一作者,中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所張亞平院士、中國(guó)科學(xué)院古脊椎所付巧妹研究員為共同通訊作者。該研究得到了中國(guó)科學(xué)院B類(lèi)戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專(zhuān)項(xiàng)、國(guó)家自然科學(xué)基金重大研究計(jì)劃、霍華德修斯醫(yī)學(xué)研究所(付巧妹)和中科院青年創(chuàng)新促進(jìn)會(huì)(王國(guó)棟)的支持。
注:本文轉(zhuǎn)載自中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所。