大規(guī)模基因測序:北方人比南方人更能飲酒、喝酒臉紅有風險
圖源:Unsplash
撰文 | 秦芳菲
責編 | 葉水送
代謝相關疾病,如二型糖尿病、肥胖等,已成為一個逐漸增加的人類公共健康問題,影響著全球致病率和致死率。很多常見代謝缺陷和疾病都是因為人群中出現(xiàn)的基因突變體造成,因此建立起代謝疾病相關的遺傳信息庫,對我們了解這類疾病、推動藥物的研發(fā)以及精準醫(yī)療來說都十分關鍵。
2020年4月30日,《細胞研究》(Cell Research)雜志發(fā)表了長文章“The ChinaMAP analytics of deep whole genome sequences in 10,588 individuals”,首次報道了中國的基因組學大數(shù)據(jù)庫中國代謝解析計劃ChinaMAP (China Metabolic Analytics Project)一期研究[1]。
ChinaMAP由國家代謝性疾病臨床醫(yī)學研究中心(上海)基于上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院牽頭開展了多項覆蓋全國的隊列研究,主要用于綜合分析中國漢族和其他主要少數(shù)民族之間基因的異質性,以及研究他們對于代謝疾病的貢獻,從而獲得生物醫(yī)學相關定量特征[2]。
ChinaMAP由國家代謝性疾病臨床醫(yī)學研究中心(上海)基于上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院牽頭開展了多項覆蓋全國的隊列研究,主要用于綜合分析中國漢族和其他主要少數(shù)民族之間基因的異質性,以及研究他們對于代謝疾病的貢獻,從而獲得生物醫(yī)學相關定量特征[2]。
ChinaMAP檢索(www.mBiobank.com)
目前,ChinaMAP主要整合了15萬例參與者的非傳染性疾病監(jiān)測,25萬例參與者相關的糖尿病人癌癥風險評估,以及5萬例參與者的上海城市化所帶來的心血管疾病風險研究。
研究者隨機選取了27個省、8個民族:漢族、回族、滿族、苗族、蒙古族、彝族、藏族和壯族,整合分析了10,588名參與者的GWAS數(shù)據(jù)。參與者平均年齡54歲,64.8%為女性。
ChinaMAP數(shù)據(jù)庫涵蓋了27個省份
ChinaMAP數(shù)據(jù)庫中所有變異的位置、注釋、頻率和數(shù)據(jù)質量等信息,可在國家代謝性疾病臨床醫(yī)學研究中心的www.mBiobank.com網站搜索。在科技部人類遺傳資源管理條例的管理和批準下,研究者可以與ChinaMAP研究團隊進一步開展合作[2]。
圖 中國人酒精代謝出現(xiàn)明顯的異質性,但是咖啡因代謝幾乎沒有明顯差異
數(shù)據(jù)分析顯示,喝酒和飲用咖啡是最常見的與健康狀況相關的飲食習慣。通過分析與乙醇代謝和依賴相關的ALDH2(rs671)和ADH1B(rs1229984 和 rs2066702)的基因多態(tài)性,發(fā)現(xiàn),中國人普遍乙醇清除率低于歐洲和非洲。也就是雖然中國酒文化盛行,但在喝酒潛力方面不如其他人種。
喝酒臉紅,隱藏著健康風險,圖源:plos.org
與亞洲人的酒后臉紅相關的基因ALDH2 rs671,亞洲人有4.50%的純合子,34.27%的雜合子,有更高的乙醛富集風險和食道癌患病風險。
從地理分布來看,在中國,北方人相比與南方人有更強乙醇代謝能力,少數(shù)民族如藏族、蒙古族、彝族等排在最前面,而嶺南漢人(廣東?。?、東南漢人(福建?。┗緣|底。
至于在咖啡因的代謝方面,國外和國內不同地區(qū)人群基本不存在偏好性,也就是調控咖啡因代謝的基因基本無差別。對咖啡的喜好雖然是后天習慣培養(yǎng)出來的,但是不管愛喝,還是不喝咖啡,代謝能力方面相差不大。
圖 ChinaMap的兩篇論文
此外,該研究團隊還在2020年2月24日,新冠疫情鼎盛之時,研究分析了新冠病毒的受體人類ACE2的基因異質性分析發(fā)表在Cell Discovery雜志上,論文發(fā)現(xiàn)現(xiàn)在還沒有證據(jù)顯示天然存在的新冠病毒S蛋白不能結合的ACE2突變體,東亞人組織中ACE2的表達量高,證明東亞人或許易感性更強[3]。
對于這一結論目前尚存爭議,此前鐘南山、錢文峰[4]、蔡國帥[5]等研究團隊表示,不同人種(亞洲人和歐洲人)細胞表面的ACE2受體表達無差異,但吸煙者特別是有吸煙史的人群,肺部ACE2表達量高,感染新冠病毒時,癥狀可能更嚴重一些。
簡而言之,有關代謝疾病相關的基因數(shù)據(jù)庫此前主要來源于歐洲,東亞人的大規(guī)模數(shù)據(jù)研究缺乏,ChinaMAP建立了高質量中國人群數(shù)據(jù)庫,可為疾病機制研究、風險評估、疾病預防、遺傳咨詢和公共衛(wèi)生管理提供依據(jù)。ChinaMAP對漢族和少數(shù)民族群體的精確遺傳結構分析也為中國人群的精準基因組學研究提供了參考數(shù)據(jù)。
編輯制版|王樂佳